Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prrx1P63013 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrx1P63013 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms