Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3cP62823 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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