Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl23aP62751 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl23aP62751 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl23aP62751 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23aP62751 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23aP62751 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpl23aP62751 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms