Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou3f4P62515 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pou3f4P62515 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms