Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrpd2P62317 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms