Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm3P62311 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms