Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rps29P62274 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms