Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ufm1P61961 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ufm1P61961 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms