Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga11P61622 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga11P61622 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga11P61622 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga11P61622 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga11P61622 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga11P61622 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga11P61622 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms