Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap25P60879 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap25P60879 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap25P60879 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap25P60879 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap25P60879 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Snap25P60879 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snap25P60879 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Snap25P60879 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snap25P60879 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap25P60879 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap25P60879 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap25P60879 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snap25P60879 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms