Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rims4P60191 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims4P60191 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims4P60191 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms