Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rin3P59729 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rin3P59729 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rin3P59729 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rin3P59729 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rin3P59729 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rin3P59729 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rin3P59729 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rin3P59729 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rin3P59729 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rin3P59729 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms