Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm6sf1P58749 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm6sf1P58749 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm6sf1P58749 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tm6sf1P58749 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tm6sf1P58749 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tm6sf1P58749 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tm6sf1P58749 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tm6sf1P58749 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tm6sf1P58749 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tm6sf1P58749 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm6sf1P58749 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tm6sf1P58749 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms