Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Paxbp1P58501 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Paxbp1P58501 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms