Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtdsplP58465 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtdsplP58465 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms