Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn4P58404 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn4P58404 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn4P58404 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strn4P58404 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strn4P58404 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn4P58404 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn4P58404 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strn4P58404 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms