Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lim2P56563 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lim2P56563 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lim2P56563 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lim2P56563 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lim2P56563 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lim2P56563 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lim2P56563 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lim2P56563 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lim2P56563 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lim2P56563 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms