Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd38P56528 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd38P56528 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd38P56528 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd38P56528 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd38P56528 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd38P56528 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms