Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pex2P55098 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pex2P55098 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pex2P55098 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pex2P55098 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pex2P55098 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pex2P55098 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pex2P55098 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pex2P55098 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms