Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms