Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acod1P54987 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Acod1P54987 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acod1P54987 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acod1P54987 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acod1P54987 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Acod1P54987 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Acod1P54987 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms