Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn5P54830 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn5P54830 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms