Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k1P53349 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k1P53349 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms