Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Efnb1P52795 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb1P52795 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms