Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efna1P52793 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efna1P52793 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna1P52793 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna1P52793 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna1P52793 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna1P52793 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna1P52793 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna1P52793 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna1P52793 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efna1P52793 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms