Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2e3P52483 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2e3P52483 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms