Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccr4P51680 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccr4P51680 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms