Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CntfP51642 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CntfP51642 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CntfP51642 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfP51642 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfP51642 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfP51642 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfP51642 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfP51642 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfP51642 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfP51642 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfP51642 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfP51642 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfP51642 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfP51642 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfP51642 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CntfP51642 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CntfP51642 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CntfP51642 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CntfP51642 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CntfP51642 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CntfP51642 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CntfP51642 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfP51642 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfP51642 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfP51642 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfP51642 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfP51642 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfP51642 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfP51642 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfP51642 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfP51642 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CntfP51642 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfP51642 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfP51642 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfP51642 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfP51642 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfP51642 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfP51642 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfP51642 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfP51642 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfP51642 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfP51642 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfP51642 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfP51642 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfP51642 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CntfP51642 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CntfP51642 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CntfP51642 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfP51642 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfP51642 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfP51642 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfP51642 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfP51642 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfP51642 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfP51642 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfP51642 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfP51642 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfP51642 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfP51642 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfP51642 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfP51642 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CntfP51642 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms