Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Opn1swP51491 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn1swP51491 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms