Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa-rs12P50716 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs12P50716 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms