Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt6aP50446 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms