Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbrP50284 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbrP50284 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LtbrP50284 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LtbrP50284 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LtbrP50284 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LtbrP50284 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtbrP50284 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LtbrP50284 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LtbrP50284 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LtbrP50284 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms