Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd7P50283 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd7P50283 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd7P50283 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd7P50283 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd7P50283 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd7P50283 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms