Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxc13P50207 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc13P50207 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms