Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cav1P49817 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cav1P49817 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cav1P49817 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cav1P49817 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms