Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcls1P49710 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms