Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk5P49615 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms