Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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PtpreP49446 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpreP49446 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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PtpreP49446 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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PtpreP49446 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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PtpreP49446 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PtpreP49446 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PtpreP49446 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpreP49446 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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PtpreP49446 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpreP49446 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpreP49446 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PtpreP49446 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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PtpreP49446 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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PtpreP49446 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpreP49446 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpreP49446 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpreP49446 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpreP49446 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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