Protein–RNA interactions for Protein: P47937

Tacr3, Neuromedin-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr3P47937 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tacr3P47937 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tacr3P47937 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tacr3P47937 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tacr3P47937 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr3P47937 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr3P47937 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr3P47937 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr3P47937 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr3P47937 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr3P47937 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr3P47937 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr3P47937 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr3P47937 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr3P47937 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr3P47937 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tacr3P47937 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms