Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax9P47242 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax9P47242 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pax9P47242 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax9P47242 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax9P47242 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax9P47242 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms