Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rab11bP46638 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab11bP46638 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms