Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkn1bP46414 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn1bP46414 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms