Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tlx1P43345 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms