Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6a1P43024 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6a1P43024 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms