Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx2-2P42586 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx2-2P42586 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx2-2P42586 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx2-2P42586 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx2-2P42586 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx2-2P42586 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx2-2P42586 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx2-2P42586 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx2-2P42586 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx2-2P42586 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms