Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TfamP40630 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TfamP40630 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TfamP40630 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TfamP40630 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TfamP40630 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TfamP40630 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TfamP40630 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TfamP40630 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TfamP40630 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TfamP40630 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TfamP40630 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TfamP40630 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TfamP40630 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TfamP40630 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TfamP40630 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TfamP40630 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TfamP40630 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TfamP40630 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TfamP40630 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TfamP40630 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms