Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tjp1P39447 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tjp1P39447 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms