Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Col18a1P39061 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col18a1P39061 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Col18a1P39061 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms