Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig1P37913 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig1P37913 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig1P37913 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig1P37913 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig1P37913 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig1P37913 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig1P37913 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lig1P37913 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lig1P37913 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms