Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn1P35821 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn1P35821 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms